Jeśli wystąpią problemy z aktualizacją listy serwerów lub utrata ustawień, niektóre pliki konfiguracyjne mogą być uszkodzone. To dzieje się najczęściej po awarii systemu lub po uaktualnieniu ze zmodyfikowanych wersji eMule. Usunięcie wszystkich plików *.met, *.ini, i *.dat z folderu gdzie zainstalowałeś eMule (NIE kasuj plików z folderu Temp!) może pomóc w usunięciu problemu. Wyłącz eMule przed skasowaniem tych plików. Po restarcie ustaw odpowiednie opcje w Ustawieniach i jeszcze raz go zrestartuj.